Alerji ve soğuk algınlığı sıklıkla birbiriyle karışır. Alerji soğuk algınlığına nazaran daha uzun sürer ( birkaç hafta yahut daha uzun). Ateş alerjide olmaz. Burun akıntısı alerjide şeffaf iken soğuk algınlığında sarı-yeşil renklidir. Alerji her yıl tıpkı vakitlerde olma eğilimindedir. Alerjide burun kaşıntısı, hapşırık, genizde ve damakta kaşıntı, gözlerde kaşıntı, sulanma ve bazende nefes almakta zorlanma, hırıltılı teneffüsün olur. Soğuk algınlığında meskendeki öteki bireylerde de emsal şikayetler birebir vakitte görülebilir. Bazen ikisi üst üste olabilir. Örneğin alerjik bir birey tedavi olmaz ise burun ve geniz akıntısı enfekte olup soğuk algınlığı eklenir. Ayırt edilemiyor ise bir alerji uzmanından vakit geçirmeden yardım alınması uygun olur